锂电池和燃料电池的最大区别在于两者的工作本质不一样。锂电池是一个储能装置，通过可逆的电化学反应实现电能的存储和释放，它必须储能再放能，完全依赖于外部能量的供应，如果外部能量是非环保的，那么锂电也就是非环保的电力，因此就有了纯电动汽车只不过是污染的二次转移之说，因为其电能主要来自于以火力发电为主的电网。燃料电池无需储能，是一个电能生产装置，它通过电催化反应将燃料中的化学能转换成电能释放出来，工作方式跟内燃机比较类似。换句话说，锂电池的能源转换为电能到化学能再到电能，而燃料电池则是直接将化学能转化成电能。从能源转化的角度，燃料电池无疑是相对锂电池更高级的发展层次。
燃料电池的工作原理：它的电池通过氢和氧的化学作用直接变成电能，而不经过燃烧，因此不产生污染物，燃料利用率很高。
锂电池的工作原理也就是混合动力的工作原理，混合动力车型中，现在(起步阶段)大多数用的是锂电池。
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